Para actualizar WordPress a 3.0 desde sus versiones anteriores, debido a sus innumerables cambios, es considerada una actualización mayor. Por eso es mejor tomar algunas precauciones a la hora de realizarla y hacer los respectivos backups de tus archivos y bases de datos.
A continuación un pequeño tutorial con el paso a paso:

1 – Descarga y descomprime WordPress 3.0:

- En Español
- En Inglés

2 – IMPORTANTE. Para evitar inconvenientes innecesarios, borra la carpeta /wp-content del archivo que descargaste y descomprimiste (carpeta wordpress).

3 – Haz una backup de la base de datos y archivos de tu blog (guarda en tu computador los archivos .htaccess, wp.config.php, y la carpeta /wp-content).

4 – Desde el panel de control desactiva todos los plugins que tengas instalados.

5 – En el archivo wp-config.php Comprueba que tiene la misma cantidad de claves que el nuevo archivo wp-config-sample.php. Son 8 en total. Si no las tiene agregalas y subelo de nuevo:

define(‘AUTH_KEY’,         ‘put your unique phrase here’);
define(‘SECURE_AUTH_KEY’,  ‘put your unique phrase here’);
define(‘LOGGED_IN_KEY’,    ‘put your unique phrase here’);
define(‘NONCE_KEY’,        ‘put your unique phrase here’);
define(‘AUTH_SALT’,        ‘put your unique phrase here’);
define(‘SECURE_AUTH_SALT’, ‘put your unique phrase here’);
define(‘LOGGED_IN_SALT’,   ‘put your unique phrase here’);
define(‘NONCE_SALT’,       ‘put your unique phrase here’);

6 – Con un cliente FTP sube todo el contenido de la carpeta wordpress exepto /wp-content (borrada en el paso 2).

7 – y por Último, actualiza las bases de datos, ingresando en panel de control:

Eso es todo. Espero lo disfruten.